Профессиональную карьеру Низамутдинов начал в 2000 году в составе костромского «Спартака» во втором дивизионе. В 2003 году Эльдар дебютировал в премьер-лиге в составе волгоградского «Ротора», но в нём не закрепился и играл в первом и втором дивизионах. Ярославским болельщикам нападающий запомнился по сезону 2007 года. В год возвращения «Шинника» в премьер-лигу Низамутдинов выступал за новотроицкую «Носту» и сумел забить в этом сезоне 16 мячей. В 2008 году форвард перешёл в подмосковные «Химки». В первом сезоне с 9 мячами стал лучшим бомбардиром «чёрно-гранатовых». В августе 2009 года на правах аренды перешёл в московский «Спартак», однако соглашение об аренде продлено не было, и после окончания сезона 2009 года Низамутдинов покинул столичный клуб. Минувший сезон футболист провёл во владикавказской «Алании» также на правах аренды, где сумел отметиться всего лишь одним забитым мячом в 23 проведённых встречах. По окончании сезона Низамутдинов возвратился в «Химки», откуда и был выкуплен ярославским клубом. Контракт футболиста рассчитан на 2,5 года.
Владимир ЛЕТУНОВСКИЙ